U rashladnoj vodi najčešće postoji prisustvo različitih mikroorganizma. Pored mikroorganizma, u sistemima koji se dopunskom vodom snabdevaju iz otvorenih vodotokova ili jezera, mogu se pojaviti i makroorganizmi.
Nekontrolisan rast mikroorganizama dovodi do formiranja naslaga tzv ’’biofilma’’. Ovakav talog i naslage izazivaju poremećaj rada rashladnog sistema i prouzrokuju iste negativne efekte na efikasnost procesa kao i depoziti drugog porekla (nerastvorne soli, korozioni produkti, fouling).
Pored smanjenja efikasnosti procesa – prisustvo mikroorganizama ugrožava i zdravlje operatera i drugih osoba koje dolaze u kontakt sa rashladnom vodom.